禁漫天堂 吕强教授课题组在国际著名期刊《Nature Communications》上发表了题为“LABind: identifying protein binding ligand-aware sites via learning interactions between ligand and protein”的研究论文。
Nature Communications是Nature出版集团旗下的重要子刊，在国际学术界具有较高影响力。在中国科学院期刊分区中列为综合性期刊1区Top，在JCR中属于Q1区。2024–2025年最新影响因子为15.7，总被引量达91.1万次，位居全球第二，并成为全球被引量最高的开放获取期刊，体现了其学术影响力与传播度。
论文聚焦于蛋白质-小分子配体结合位点识别这一核心问题，该问题是理解蛋白质功能与药物作用机制的重要环节，对药物发现和蛋白质工程具有关键意义。传统方法往往需针对不同配体分别建模，难以推广至未知配体，泛化能力有限。针对这一挑战，课题组提出了创新模型LABind。该模型基于GraphTransformer捕捉蛋白质局部空间结构中的结合模式，并引入 交叉注意力机制 学习蛋白质与配体之间的特异性相互作用，从而在统一框架下实现多种配体结合位点的高精度预测。实验结果表明，LABind不仅能准确识别训练集中已出现的小分子配体结合位点，在未见配体的预测中也展现出较强的泛化能力；同时，在辅助蛋白质-配体对接任务中提升了构象筛选的效率与准确性，为药物虚拟筛选和功能性蛋白质设计提供了高效的计算工具。
硕士研究生张治军与权丽君副教授为共同第一作者，权丽君副教授、吴庭芳副教授和吕强教授为论文的通讯作者。该研究工作得到了国家自然科学基金面上项目的支持。论文链接：//www.nature.com/articles/s41467-025-62899-0